U Šibensko-kninskoj županiji glasovalo je 94.653, odnosno 41,15 posto birača. Na nivou županije pobijedio je Milanović s 64.251 glasom. Primorcu su birači dali 27.369 glasa. Zoran Milanović pobjedio je u svim gradovima u županiji osim u Drnišu. Rezultate drugog kruga predsjedničkih izbora po gradovima pogledajte u nastavku.

Šibenik:
Zoran Milanović
Broj glasova: 10.702
Dragan Primorac
Broj glasova: 4.149

Skradin:
Zoran Milanović
Broj glasova: 575
Dragan Primorac
Broj glasova: 541

Drniš:
Dragan Primorac
Broj glasova: 1.207
Zoran Milanović
Broj glasova: 986

Knin:
Zoran Milanović
Broj glasova: 2.170
Dragan Primorac
Broj glasova: 1.195

Vodice:
Zoran Milanović
Broj glasova: 2.243
Dragan Primorac
Broj glasova: 1.182